Ejercicio 2

En este ejercicio vamos a automatizar la detección del genotipo de la práctica 2. Para poder lanzar programas desde Python, necesitamos la función system.

Usamos primero código de los scripts que hemos desarrollado antes:

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Cuestiones

  • Añadir ‘samtools mpileup’ & ‘bcftools view’  al programa para complementar el flujo de trabajo