Es importante subrayar que los codones no se cuentan cómo los trinucleótidos. Estos últimos se cuentan mediante compseq con una ventana solapante. Los codones son también trinucléotidos, pero NO solapantes. Otra cuestión a tener en cuenta es que los codones hay que contarlos en la fase correcta. El recuento de codones hay que hacerlo pues con el programa cusp. El uso de codones (o dialecto genético) es especie-específico en organismos unicelulares y región-específico en multicelulares.
- Tabla del código genético standard
- CDS de la alfa-globina humana
- cusp – EMBOSS
- Codon Usage Database
- Ejercicio: Usando cusp, determine y compare las tablas de uso de codones de dos genes (CDSs) del HIV.