Se trata de generar una filogenia utilizando alguna proteína que sea de interés: rpe, rpoB, p53, etc. También se puede usar la proteína de la secuencia anónima asignada.
Recolecte los datos para hacer un alineamiento múltiple de la manera que se ha visto en el apartado ‘Recolección de datos’.
Una vez obtenido y formateado adecuadamente el archivo multi-fasta, utilice ClustalW2 para obtener el alineamiento múltiple:
Copie el alineamiento múltiple obtenido, y utilícelo como datos para generar una filogenia mediante ‘ClustalW2 – Filogenia’:
Recuerde poner en ‘on’ las pestañas ‘Distance correction’ y ‘Exclude Gaps’.
Copie el arbol resultante (en formato Newick o de paréntesis anidados), y represente la filogenia mediante Phylodendron, PhyloWidget, OneZoom…