Análisis de metilación

  1. Visualizaremos los niveles de metilación de la región chr6:107794482..108007281 mediante el JBrowser de la base de datos NGSmethDB.
    • ¿Qué observamos?
    • ¿Qué relación hay entre los niveles de metilación y la predicción de las islas?
    • ¿En qué regiones génicas se ubican las zonas no-metiladas?
    • ¿Hay alguna región con metilación diferencial?
  2. Buscaremos en el Genome Browser si existe alguna anotación de un transcrito alternativo.
  3. Visualizaremos la metilación de la secuencia anónima.
  4. Descargaremos los datos de metilación calculando la metilación media en la región promotora (y en las islas CpG, si existen).