Autoevaluación

¿Cual de las dos secuencias siguientes generaría la proteína más larga?

Secuencia 1
Secuencia 2

Se han obtenido las siguientessecuencias a partir de dos pacientes: proteína 1 y proteína 2

  1. ¿De qué gen o proteína se trata?
  2. ¿Qué diferencias se pueden observar?

Análisis del gen DNMT1 en humanos

  1. ¿Cual es el nombre del transcrito de la isoforma a de este gen en la base de datos RefSeq gene?
  2. ¿Cuales son las coordenadas cromosómicas de esta isofoma?
  3. ¿Cuantas isoformas tiene DNMT1 en humanos? ¿Y en ratón?
  4. ¿Cual es el número de exones codificantes de las isoformas a y b?
  5. ¿Que longitud tiene la región codificante y el mRNA de la isoforma a en humanos y ratón?
  6. Si definimos la region promotora como [TSS-200bp;TSS]. ¿Qué contenido en G+C tiene esta región? ¿Qué contenido en G+C tiene la región codificante?
  7. ¿Tiene DNMT1 una isla CpG en en el promotor?
  8. ¿En qué otras especies existe un gen homólogo de DNMT1?

Se han obtenido las siguientes secuencias de humanos: secuencia 1 y secuencia 2

¿A qué conclusión se puede llegar tras un análisis composicional?

  1. ¿Corresponde alguna de esas dos secuencias a una isla CpG?
  2. ¿De qué cromosomas humanos provienen ambas secuencias?
  3. ¿Cuantas islas CpG contiene la secuencia 2?
  4. ¿Cuales son los estados de metilación de las islas CpG de la secuencia 2?