La primera tarea para predecir genes en una secuencia anónima es localizar los marcos abiertos de lectura, es decir segmentos de ADN libres de codones de stop en alguna de las fases (Open Reading Frames, ORFs).
- ORF Finder – NCBI, USA
- FramePlot – NIH, Japón
Para practicar con estos programas, utilizaremos las primeras 10 kbp de E. coli. Compararemos los resultados con la propia anotación de este genoma.