{"id":1514,"date":"2017-11-09T13:54:36","date_gmt":"2017-11-09T11:54:36","guid":{"rendered":"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/?page_id=1514"},"modified":"2023-09-12T13:10:31","modified_gmt":"2023-09-12T11:10:31","slug":"ejercicio-2","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/ejercicio-2\/","title":{"rendered":"Ejercicio 2"},"content":{"rendered":"<p>En este ejercicio vamos a automatizar la detecci\u00f3n del genotipo de la\u00a0<a href=\"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/practica-2\/\">pr\u00e1ctica 2.<\/a> Para poder lanzar programas desde Python, necesitamos la funci\u00f3n <a href=\"https:\/\/perldoc.perl.org\/functions\/system.html\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">system<\/a>.<\/p>\n<p>Usamos primero c\u00f3digo de los scripts que hemos desarrollado antes:<\/p>\n<pre><span style=\"color: #339966;\"># <\/span>\r\n<\/pre>\n<h3>Cuestiones<\/h3>\n<ul>\n<li>A\u00f1adir &#8216;samtools mpileup&#8217; &amp; &#8216;bcftools view&#8217;\u00a0 al programa para complementar el flujo de trabajo<\/li>\n<\/ul>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>En este ejercicio vamos a automatizar la detecci\u00f3n del genotipo de la\u00a0pr\u00e1ctica 2. Para poder lanzar programas desde Python, necesitamos la funci\u00f3n system. Usamos primero c\u00f3digo de los scripts que hemos desarrollado antes: # Cuestiones A\u00f1adir &#8216;samtools mpileup&#8217; &amp; &#8216;bcftools <a href=\"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/ejercicio-2\/\" class=\"read-more\">Read More &#8230;<\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"parent":0,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1514"}],"collection":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=1514"}],"version-history":[{"count":7,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1514\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":2378,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1514\/revisions\/2378"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=1514"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}