LOCALIZACI\u00d3N DE LA POSICI\u00d3N DEL ORIGEN DE REPLICACI\u00d3N<\/b><\/p>\n
EN UN GENOMA BACTERIANO POR M\u00c9TODOS BIOINFORM\u00c1TICOS<\/b><\/p>\n
Antonio Mar\u00edn<\/b><\/a><\/p>\n Departamento de Gen\u00e9tica \u2013 Universidad de Sevilla<\/b><\/p>\n \u00a0Objetivo<\/b><\/p>\n El objetivo de esta pr\u00e1ctica es afianzar algunos conceptos sobre el modo de replicaci\u00f3n de los genomas bacterianos, poner de manifiesto las diferencias de composici\u00f3n entre la hebra de replicaci\u00f3n adelantada (leading) y retrasada (lagging) y eventualmente localizar la posici\u00f3n del origen de replicaci\u00f3n. Adicionalmente, esta pr\u00e1ctica puede servir para adquirir conocimientos muy b\u00e1sicos sobre la estructura y funcionamiento del programa inform\u00e1tico utilizado. La pr\u00e1ctica est\u00e1 inspirada en el divertido art\u00edculo de Jean Lobry \u2018Genomic landscapes\u2019. Microbiology Today, 26: 164-165, 1999; [PDF<\/a>].<\/p>\n Fundamento de la pr\u00e1ctica: replicaci\u00f3n y mutaciones<\/b><\/p>\n La replicaci\u00f3n del ADN de los cromosomas bacterianos se hace a partir de un origen \u00fanico de replicaci\u00f3n (regi\u00f3n oriC<\/i>) de forma \u2018bidireccional\u2019 form\u00e1ndose dos horquillas de replicaci\u00f3n que acaban encontr\u00e1ndose en la regi\u00f3n ter<\/i> situada en las ant\u00edpodas de\u00a0 oriC<\/i>. La s\u00edntesis de ADN s\u00f3lo ocurre en sentido 5\u2019\u21923\u2019. Debido a que las cadenas del ADN son \u2018antiparalelas\u2019, en cada horquilla de replicaci\u00f3n una de las cadenas se replica en la misma direcci\u00f3n con que se desplaza la horquilla de replicaci\u00f3n y la otra cadena en la direcci\u00f3n contraria.\u00a0 La cadena que se replica en el mismo sentido que avanza la horquilla lo hace de forma continua (cadena adelantada o cadena leader) y la otra cadena se sintetiza de modo discontinuo (cadena retrasada o hebra lagging).\u00a0 Los fragmentos de la cadena retrasada que se sintetizan de forma discontinua se llaman fragmentos de Okazaki.<\/p>\n Las mutaciones de citosina a timina (transiciones C \u2192T) son las m\u00e1s frecuentes en la mayor\u00eda de los genomas bacterianos.\u00a0 Probablemente, una parte importante de esas transiciones ocurren durante la replicaci\u00f3n como consecuencia de la desaminaci\u00f3n de la citosina.\u00a0 La desaminaci\u00f3n de la citosina es m\u00e1s probable cuando las dos cadenas del ADN est\u00e1n separadas (estado monocatenario) y por eso pueden ocurrir con mayor frecuencia en la cadena adelantada mientras \u00e9sta se encuentra en estado monocatenario esperando a que el siguiente fragmento de Okazaki restaure el estado bicatenario.<\/p>\n A lo largo del proceso de evoluci\u00f3n de las especies, este sesgo mutacional tiene como consecuencia un aumento en la frecuencia relativa de las bases G y T en la cadena adelantada y de las bases A y C en la cadena retrasada.\u00a0 Las diferencias de composici\u00f3n entre las cadenas adelantadas y las cadenas retrasadas se pueden poner de manifiesto simplemente contando el n\u00famero de nucle\u00f3tidos, y en \u00faltimo t\u00e9rmino, se puede llegar a predecir la posici\u00f3n del origen de replicaci\u00f3n recorriendo un genoma y viendo donde tienen lugar cambios de composici\u00f3n.<\/p>\n Jean R. Lobry. 1999. Genomic landscapes. Microbiology Today 26: 164-165. [PDF<\/a>]<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" LOCALIZACI\u00d3N DE LA POSICI\u00d3N DEL ORIGEN DE REPLICACI\u00d3N EN UN GENOMA BACTERIANO POR M\u00c9TODOS BIOINFORM\u00c1TICOS Antonio Mar\u00edn Departamento de Gen\u00e9tica \u2013 Universidad de Sevilla \u00a0Objetivo El objetivo de esta pr\u00e1ctica es afianzar algunos conceptos sobre el modo de replicaci\u00f3n de Read More …<\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"parent":0,"menu_order":12,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/942"}],"collection":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=942"}],"version-history":[{"count":5,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/942\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":983,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/942\/revisions\/983"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=942"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}Presentaci\u00f3n [PDF<\/a>]<\/h2>\n
Bibliograf\u00eda<\/h2>\n