{"id":96,"date":"2013-05-29T22:38:56","date_gmt":"2013-05-29T20:38:56","guid":{"rendered":"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/?page_id=96"},"modified":"2025-12-03T11:12:18","modified_gmt":"2025-12-03T09:12:18","slug":"contenidos","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/contenidos\/","title":{"rendered":"Contenidos"},"content":{"rendered":"<h1><a href=\"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/faqs-frequently-asked-questions\/\">FAQs<\/a><\/h1>\n<p><a href=\"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/intro-biocomp\/\">Tema 0. Introducci\u00f3n a la biolog\u00eda computacional y bioinform\u00e1tica<\/a><\/p>\n<ul>\n<li><a href=\"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/wp-content\/uploads\/2022\/09\/Introduccion_biocomp_22.pdf\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Presentaci\u00f3n Introducci\u00f3n<\/a><\/li>\n<\/ul>\n<p><a href=\"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/intro-alineamiento\/\">Tema 1. Alineamientos locales y globales. M\u00e9todos exactos y heur\u00edsticos. Sistemas de puntuaci\u00f3n. Matriz de puntos. Mapeo frente al genoma. Blast, Blat y bowtie.<\/a><\/p>\n<ul>\n<li><a href=\"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/wp-content\/uploads\/2021\/09\/Alineamientos.pdf\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Presentaci\u00f3n Alineamientos<\/a><\/li>\n<li><strong><a href=\"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/wp-content\/uploads\/2021\/09\/Protocolo_asincrono_tema1_alineamientos.pdf\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Protocolo as\u00edncrono<\/a> tema 1<\/strong><\/li>\n<li><a href=\"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/alineamientos\/\"><strong><span style=\"color: #993366;\">Ejercicios Alineamientos<\/span><\/strong><\/a><\/li>\n<\/ul>\n<p><a href=\"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/linux\/\">Tema 2. Sistema operativo Linux. Uso en l\u00ednea de comando. Instrucciones b\u00e1sicas (copiar y eliminar ficheros, hacer directorios, visualizar el contenido de un directorio, etc).<\/a><\/p>\n<ul>\n<li><a href=\"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/ejercicios-linux\/\"><strong><span style=\"color: #993366;\">Ejercicios Linux\u00a0<\/span><\/strong><\/a><\/li>\n<li><a href=\"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/herramientas-en-linux\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Herramientas en Linux<\/a><\/li>\n<\/ul>\n<p><a href=\"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/intro-emboss\/\">Tema 3. An\u00e1lisis b\u00e1sico de secuencias con EMBOSS. Manipular secuencias, porcentaje en G+C, estad\u00edstica de dinucle\u00f3tidos, trinucleotidos frente a codones.<\/a><\/p>\n<ul>\n<li><a href=\"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/analisis-basico\/\"><strong><span style=\"color: #993366;\">Ejercicios EMBOSS <\/span><\/strong><\/a><\/li>\n<li><strong><a href=\"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/wp-content\/uploads\/2017\/10\/AnalisisBasico-1.pdf\">Presentaci\u00f3n<\/a><\/strong><\/li>\n<li><strong><a href=\"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/wp-content\/uploads\/2021\/09\/Protocolo_asincrono_-temp3_Analisis_basico.pdf\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Protocolo as\u00edncrono tema 3<\/a><\/strong><\/li>\n<\/ul>\n<p><a href=\"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/python\/\">Tema 4. Programaci\u00f3n en Python. Sem\u00e1ntica y sintaxis b\u00e1sica. Variables, funciones, condicionales y bucles. Generar un script para calcular propiedades b\u00e1sicos de una secuencia de ADN.<\/a><\/p>\n<ul>\n<li><a href=\"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/practica1\/\"><strong><span style=\"color: #993366;\">Pr\u00e1ctica programaci\u00f3n\u00a0<\/span><\/strong><\/a><\/li>\n<li><a href=\"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/entorno-virtual\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Entorno virtual y instalaci\u00f3n de paquetes<\/a><\/li>\n<li><a href=\"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/generar-graficos-con-python-pandas-y-matplotlibs\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">DataFrames<\/a><\/li>\n<li><a href=\"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/graficos\/\">Visualizaci\u00f3n<\/a><\/li>\n<li><a href=\"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/trabajar-con-secuencias-el-paquete-pyfaidx\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Leer y manipular secuencias<\/a><\/li>\n<\/ul>\n<p><a href=\"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/intro-ngs-2\/\">Tema 5. Secuenciaci\u00f3n masiva. Diferentes tipos de secuenciaci\u00f3n masiva. Estimaci\u00f3n de la tasa de errores de secuenciaci\u00f3n. El formato fastq. Determinar la calidad de la secuenciaci\u00f3n.<\/a><\/p>\n<ul>\n<li><a href=\"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/intro-ngs\/\"><strong><span style=\"color: #993366;\">Ejercicios NGS <\/span><\/strong><\/a><\/li>\n<li><strong><a href=\"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/wp-content\/uploads\/2017\/11\/secuenciacion_masiva_2017-1.pdf\">Presentaci\u00f3n<\/a><\/strong><\/li>\n<\/ul>\n<p><a href=\"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/genotipado\/\">Tema 6. Detectar variaci\u00f3n de nucle\u00f3tido \u00fanico (SNV) e inserciones y deleciones cortas. Determinar la regi\u00f3n (codificante o no-codificante) y el efecto de la variaci\u00f3n. Aplicaciones en medicina forense, diagn\u00f3stico gen\u00e9tico y tests de paternidad.<\/a><\/p>\n<ul>\n<li><a href=\"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/practica-2\/\"><strong><span style=\"color: #993366;\">Pr\u00e1ctica Genotipado <\/span><\/strong><\/a><\/li>\n<li><strong><a href=\"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/wp-content\/uploads\/2017\/11\/genotipar_2017-5.pdf\">Presentaci\u00f3n<\/a><\/strong><\/li>\n<\/ul>\n<p><a href=\"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/microrna\/\">Tema 7. microRNAs. Biog\u00e9nesis y funci\u00f3n de microRNAs. Determinar los niveles de expresi\u00f3n de microRNAs. Detectar expresi\u00f3n diferencial. Detectar posibles dianas.<\/a><\/p>\n<ul>\n<li><a href=\"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/preprocesar-smrna-seq\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Preprocesar<\/a><\/li>\n<li><a href=\"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/practica-3-2025\/\"><strong><span style=\"color: #993366;\">Pr\u00e1ctica 3-2025<\/span><\/strong><\/a><\/li>\n<\/ul>\n<p><a href=\"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/ontologias-2\/\">Tema 8. Ontolog\u00edas y su importancia en la biocomputaci\u00f3n. T\u00e9rminos GO y Rutas KEGG. Enriquecimiento relativo de t\u00e9rminos funcionales. Test estad\u00edstico y significaci\u00f3n del enriquecimiento.<\/a><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>FAQs Tema 0. Introducci\u00f3n a la biolog\u00eda computacional y bioinform\u00e1tica Presentaci\u00f3n Introducci\u00f3n Tema 1. Alineamientos locales y globales. M\u00e9todos exactos y heur\u00edsticos. Sistemas de puntuaci\u00f3n. Matriz de puntos. Mapeo frente al genoma. 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Presentaci\u00f3n Alineamientos Protocolo as\u00edncrono <a href=\"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/contenidos\/\" class=\"read-more\">Read More &#8230;<\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"parent":0,"menu_order":2,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/96"}],"collection":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=96"}],"version-history":[{"count":21,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/96\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":2650,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/96\/revisions\/2650"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/biocomputacion\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=96"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}