{"id":1406,"date":"2020-02-06T21:13:40","date_gmt":"2020-02-06T19:13:40","guid":{"rendered":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/?page_id=1406"},"modified":"2026-01-24T10:49:15","modified_gmt":"2026-01-24T08:49:15","slug":"trabajos-personales","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/trabajos-personales\/","title":{"rendered":"Trabajos personales"},"content":{"rendered":"\n<h3>1. An\u00e1lisis de la secuencia humana y presentaci\u00f3n oral de los resultados (30 puntos)<\/h3>\n\n\n\n<p>Este trabajo se defiende en forma de seminario los&nbsp;<a rel=\"noreferrer noopener\" href=\"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-content\/uploads\/2025\/02\/Lista-de-exponentes-1.pdf\" target=\"_blank\">d\u00edas 11\/12 de febrero<\/a><\/p>\n\n\n\n<p>El an\u00e1lisis debe de comprender m\u00ednimamente los siguientes puntos<\/p>\n\n\n\n<ol><li>Las coordenadas cromos\u00f3micas de la secuencia en dos ensamblados diferentes<\/li><li>El gen que contiene:<ul><li>Descripci\u00f3n del gen: n\u00famero isoformas (RefSeq), n\u00famero de exones<\/li><li>Funci\u00f3n del gen<\/li><li>Tabla con el uso de codones<\/li><li>Una filogenia usando al menos 5 genes hom\u00f3logos.<\/li><\/ul><\/li><li>Anal\u00edsis composicional de la secuencia<\/li><\/ol>\n\n\n\n<ul><li>An\u00e1lisis de la fluctuaci\u00f3n del contenido en G+C<ul><li>\u00bfExisten picos y valles?<\/li><li>\u00bfA que corresponden?<\/li><\/ul><\/li><li>An\u00e1lisis de la composici\u00f3n en dinucle\u00f3tidos<\/li><\/ul>\n\n\n\n<h3>2 Caracterizaci\u00f3n del ensamblado y elaboraci\u00f3n de un informe<\/h3>\n\n\n\n<h4><span id=\"Fecha_limite_de_entrega_lunes_17_de_febrero_2_Prediccion_de_genes_en_procariotas_20_puntos\">Fecha l\u00edmite de entrega: 4 de marzo 2024.&nbsp;<\/span><\/h4>\n\n\n\n<p>El informe han de un constar los resultados que hemos obtenido en las clases presenciales junto con una breve descripci\u00f3n como se han obtenido (10 puntos).<\/p>\n\n\n\n<p>Adicionalmente (10 puntos):<\/p>\n\n\n\n<ul><li>determinar un genoma de referencia<\/li><li>anotar los genes ribos\u00f3micos en el ensamblado<\/li><li>determinar las coordenadas de los 5 contigs mas largos en el genoma de referencia<\/li><\/ul>\n\n\n\n<ul id=\"block-838bd00e-d0c3-4c5e-9466-66c952e678c4\"><li><s>Caracterizar la calidad del ensamblado<\/s><\/li><li><s>Calcular en G+C del ensamblado<\/s><\/li><li><s>Predecir genes codificantes <\/s><ul id=\"block-838bd00e-d0c3-4c5e-9466-66c952e678c4\" class=\"block-editor-rich-text__editable block-editor-block-list__block wp-block is-selected wp-block-list rich-text\" tabindex=\"0\" role=\"document\" contenteditable=\"true\" aria-multiline=\"true\" aria-label=\"Block: List\" data-block=\"838bd00e-d0c3-4c5e-9466-66c952e678c4\" data-type=\"core\/list\" data-title=\"List\"><li><s>Cuantos genes codificantes se predicen<\/s><\/li><li><s>Que % del ensamblado cubren los genes codificantes <\/s><\/li><\/ul><\/li><li><s>Anotar los genes predichos <\/s><ul id=\"block-838bd00e-d0c3-4c5e-9466-66c952e678c4\" class=\"block-editor-rich-text__editable block-editor-block-list__block wp-block is-selected wp-block-list rich-text\" tabindex=\"0\" role=\"document\" contenteditable=\"true\" aria-multiline=\"true\" aria-label=\"Block: List\" data-block=\"838bd00e-d0c3-4c5e-9466-66c952e678c4\" data-type=\"core\/list\" data-title=\"List\"><li><s>\u00bfQue par\u00e1metros del Blast influyen en el % de genes predichos anotados? <\/s><\/li><\/ul><\/li><li><s>Analizar la variaci\u00f3n en el G+C a lo largo del contig mas largo<\/s><\/li><li><s>\u00bfPodemos determinar el orden real de los contigs en el genoma?<\/s><\/li><li><s>Detectar genes del ARN ribos\u00f3mico<\/s><\/li><li><s>Determinar el uso de codones <\/s><ul id=\"block-838bd00e-d0c3-4c5e-9466-66c952e678c4\" class=\"block-editor-rich-text__editable block-editor-block-list__block wp-block is-selected wp-block-list rich-text\" tabindex=\"0\" role=\"document\" contenteditable=\"true\" aria-multiline=\"true\" aria-label=\"Block: List\" data-block=\"838bd00e-d0c3-4c5e-9466-66c952e678c4\" data-type=\"core\/list\" data-title=\"List\"><li><s>\u00bfLos genes predichos tienen un uso de codones diferentes comparado con la anotaci\u00f3n del genoma de referencia?<\/s><\/li><li><s>\u00bfLos genes de resistencia tienen un uso de codones diferentes? <\/s><\/li><\/ul><\/li><\/ul>\n\n\n\n<p><\/p>\n\n\n\n<h4><\/h4>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>1. An\u00e1lisis de la secuencia humana y presentaci\u00f3n oral de los resultados (30 puntos) Este trabajo se defiende en forma de seminario los&nbsp;d\u00edas 11\/12 de febrero El an\u00e1lisis debe de comprender m\u00ednimamente los siguientes puntos Las coordenadas cromos\u00f3micas de la secuencia en dos ensamblados diferentes El gen que contiene: Descripci\u00f3n del gen: n\u00famero isoformas (RefSeq), &hellip; <a href=\"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/trabajos-personales\/\">Continue reading <span class=\"meta-nav\">&rarr;<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"parent":0,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1406"}],"collection":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=1406"}],"version-history":[{"count":27,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1406\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":1961,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1406\/revisions\/1961"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=1406"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}