{"id":1489,"date":"2021-02-11T23:50:26","date_gmt":"2021-02-11T21:50:26","guid":{"rendered":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/?page_id=1489"},"modified":"2022-02-08T09:57:30","modified_gmt":"2022-02-08T07:57:30","slug":"examen-20-21","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/examen-20-21\/","title":{"rendered":"Examen 20-21"},"content":{"rendered":"<p><strong>Generalidades:<\/strong><\/p>\n<p>Duraci\u00f3n: 2 horas<\/p>\n<p><strong>Medios:<\/strong>\u00a0Todo MENOS el contacto con terceros mediante m\u00f3vil, programas de chateo u otras formas de comunicaci\u00f3n<\/p>\n<p>Las respuestas se dar\u00e1n en un fichero de texto (por ejemplo Word o PDF) que se mandar\u00e1 a\u00a0<u><a href=\"mailto:hackenberg@ugr.es\">hackenberg@go.ugr.es<\/a> <\/u>al finalizar la prueba poniendo \u2018prueba bioinform\u00e1tica\u2019 en el asunto. Nombrar el fichero de texto usando nombre\/apellidos.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>1) (10 puntos) Tenemos las coordenadas gen\u00f3micas del ensamblado mm9 del rat\u00f3n (Mus musculus)\u00a0chr12: 57,770,212 &#8211; 57,902,714<\/p>\n<ul>\n<li>Calcular el G+C de la secuencia<\/li>\n<li>Calcular las frecuencias de dinucle\u00f3tidos<\/li>\n<li>\u00bfQue dinucle\u00f3tidos ocurren m\u00e1s frecuente y cuales menos frecuente de los esperado por azar? Razonar las frecuencias de al menos 3 dinucle\u00f3tidos diferentes<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>2) (10 puntos) Tenemos la siguiente\u00a0<a href=\"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-content\/uploads\/2021\/02\/bacSeq.txt\">secuencia\u00a0<\/a>de ADN de origen bacteriano.<\/p>\n<ul>\n<li>\u00bfCu\u00e1ntas CDS completas contiene esta secuencia?<\/li>\n<li>Anotar los nombres de los genes y la longitud de sus CDSs<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>3) (10 puntos) Se ha obtenido la secuencia de un mRNA de dos individuos: <a href=\"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-content\/uploads\/2021\/02\/kr1-1.txt\">secuencia1<\/a> y <a href=\"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-content\/uploads\/2021\/02\/kr2.txt\">secuencia2<\/a><\/p>\n<ul>\n<li>Dar el nombre del transcrito (RefSeq) y nombre del gen<\/li>\n<li>\u00bfCu\u00e1l de los dos individuos tiene mayor probabilidad de sufrir una enfermedad grave en el futuro? Razonar brevemente<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>4) (14 puntos) Tenemos la siguiente secuencia cromos\u00f3mica: <a href=\"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-content\/uploads\/2021\/02\/secuenciaPrediccion.txt\">secuencia<\/a>.<\/p>\n<ul>\n<li>Determinar las coordenadas de la secuencia en el genoma humano<\/li>\n<li>\u00bfCu\u00e1ntos genes hay en \u00e9sta regi\u00f3n?<\/li>\n<li>\u00bfCu\u00e1ntos transcritos hay en RefSeq gene anotados para este gen?<\/li>\n<li>Llevar a cabo una predicci\u00f3n de genes y comparar con la anotaci\u00f3n<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>5) (6 puntos) Tenemos el transcrito NM_000546.6<\/p>\n<ul>\n<li>\u00bfA qu\u00e9 gen y a que especie pertenece?<\/li>\n<li>\u00bfQu\u00e9 es la longitud y el contenido en G+C de su regi\u00f3n codificante?<\/li>\n<\/ul>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Generalidades: Duraci\u00f3n: 2 horas Medios:\u00a0Todo MENOS el contacto con terceros mediante m\u00f3vil, programas de chateo u otras formas de comunicaci\u00f3n Las respuestas se dar\u00e1n en un fichero de texto (por ejemplo Word o PDF) que se mandar\u00e1 a\u00a0hackenberg@go.ugr.es al finalizar la prueba poniendo \u2018prueba bioinform\u00e1tica\u2019 en el asunto. Nombrar el fichero de texto usando nombre\/apellidos. &hellip; <a href=\"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/examen-20-21\/\">Continue reading <span class=\"meta-nav\">&rarr;<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"parent":0,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1489"}],"collection":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=1489"}],"version-history":[{"count":4,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1489\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":1495,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1489\/revisions\/1495"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=1489"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}