Permite descargar datos gen\u00f3micos en diferentes formatos: bed, gff\/gtf, fasta, etc. Los datos a los que podemos acceder mediante el Table Browser son los mismos que podemos visualizar en el Navegador Gen\u00f3mico.<\/p>\n Tras pulsar ‘getBED’ obtendr\u00e1 la tabla:<\/p>\n Puede guardar la tabla a disco (desde el men\u00fa Archivo del navegador -> Guardar como: ‘chr21_exons.txt’) e importarla en una hoja de c\u00e1lculo para obtener una estad\u00edstica b\u00e1sica de la longitud de los exones del cromosoma 21 (longitud media, m\u00ednima y m\u00e1xima, desviaci\u00f3n standard, histograma de frecuencias, etc.).<\/p>\n Si repite la operaci\u00f3n con los intrones puede hacer un estudio comparado de las longitudes de exones e intrones.<\/p>\n Pinche en filter<\/strong> -> create:<\/p>\n Tras presionar sobre ‘Submit’ -> ‘Get output’ -> get BED obtendr\u00e1 la tabla con las Alus del cromosoma 21 humano:<\/p>\n Si importa esta tabla en una hoja de c\u00e1lculo, puede obtener una estad\u00edstica b\u00e1sica de las longitudes de los retrotransposones Alu en el cromosoma 21, compararla con la de otros cromosomas, etc.<\/p>\n Secuencia an\u00f3nima de ejemplo<\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Los navegadores gen\u00f3micos permiten explorar genomas completos, mostrando las diferentes anotaciones en pistas apiladas unas sobre otras. Esto permite resumir de manera gr\u00e1fica una ingente cantidad de informaci\u00f3n sobre una determinada regi\u00f3n del genoma. UCSC Genome Browser Algunos genes interesantes El color de ojos: OCA2 El color rojo del pelo: MCR1 Fibrosis qu\u00edstica: CFTR C\u00e1ncer … Continue reading ![\"human-chr7-99546108-99569759-ucsc-genome-browser-v338-2016-09-23-11-22-14\"](\"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/genomica\/wp-content\/uploads\/2016\/09\/Human-chr7-99546108-99569759-UCSC-Genome-Browser-v338-2016-09-23-11-22-14.png\")
<\/a><\/p>\nAlgunos genes interesantes<\/span><\/h3>\n
\n
Table Browser<\/a><\/h3>\n
![\"table-browser-2016-09-23-11-25-37\"](\"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/genomica\/wp-content\/uploads\/2016\/09\/Table-Browser-2016-09-23-11-25-37.png\")
<\/a><\/p>\nEl formato BED<\/a><\/h3>\n
Coordenadas UCSC<\/a><\/h3>\n
Operaciones sencillas con Table Browser<\/a><\/h3>\n
Obtener los exones de los genes RefSeq del cromosoma 21 humano<\/h4>\n
![\"table-browser-2016-09-23-12-21-28\"](\"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/genomica\/wp-content\/uploads\/2016\/09\/Table-Browser-2016-09-23-12-21-28.png\")
<\/a><\/p>\n
\n![\"output-refgene-as-bed-2016-09-23-12-23-46\"](\"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/genomica\/wp-content\/uploads\/2016\/09\/Output-refGene-as-BED-2016-09-23-12-23-46.png\")
<\/a><\/p>\nchr21\t5026479\t5026630\tNM_001283052_cds_2_0_chr21_5026480_f\t0\t+\nchr21\t5027934\t5028225\tNM_001283052_cds_3_0_chr21_5027935_f\t0\t+\nchr21\t5032052\t5032217\tNM_001283052_cds_4_0_chr21_5032053_f\t0\t+\n---<\/span><\/pre>\nUso de filtros: Obtener los retrotransposones de la familia Alu en el cromosoma 21 humano<\/h4>\n
![\"table-browser-2016-09-23-12-47-52\"](\"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/genomica\/wp-content\/uploads\/2016\/09\/Table-Browser-2016-09-23-12-47-52.png\")
<\/a><\/p>\n![\"filter-on-fields-from-hg38-rmsk-2016-09-23-12-50-52\"](\"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/genomica\/wp-content\/uploads\/2016\/09\/Filter-on-Fields-from-hg38.rmsk-2016-09-23-12-50-52.png\")
<\/a><\/p>\nchr21\t5010000\t5010061\tAluYk11\t465\t-\nchr21\t5010563\t5010892\tAluY\t2392\t-\nchr21\t5010955\t5011213\tAluJb\t1590\t+\n---\n<\/span><\/pre>\nBLAT<\/a><\/h3>\n