{"id":929,"date":"2013-10-21T17:47:22","date_gmt":"2013-10-21T15:47:22","guid":{"rendered":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/?page_id=929"},"modified":"2020-02-13T20:43:59","modified_gmt":"2020-02-13T18:43:59","slug":"galaxy","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/galaxy\/","title":{"rendered":"An\u00e1lisis en genoma completo mediante Galaxy"},"content":{"rendered":"<div class=\"entry-content clearfix\">\n<div class=\"entry-content clearfix\">\n<p><b>Galaxy<\/b> es una plataforma web de software libre para el an\u00e1lisis de datos en investigaci\u00f3n biom\u00e9dica.<\/p>\n<p><a href=\"http:\/\/wiki.galaxyproject.org\/Learn\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Galaxy wiki<\/a>.<\/p>\n<h2>Implementaciones de Galaxy<\/h2>\n<p>Existen muchas <a href=\"http:\/\/wiki.galaxyproject.org\/PublicGalaxyServers\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">implementaciones de Galaxy<\/a>, usaremos las dos siguientes:<\/p>\n<ul>\n<li><a href=\"https:\/\/usegalaxy.org\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Galaxy original,\u00a0<\/a>Texas Advanced Computing Center<\/li>\n<li><a href=\"https:\/\/usegalaxy.eu\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Galaxy Europe<\/a><\/li>\n<\/ul>\n<p>En esta pr\u00e1ctica veremos los siguientes aspectos de Galaxy:<\/p>\n<ul>\n<li>Extracci\u00f3n de datos desde el servidor de la UCSC<\/li>\n<li>Manipulaci\u00f3n b\u00e1sica de datos<\/li>\n<li>Las \u2018Historias\u2019 en Galaxy<\/li>\n<\/ul>\n<p>Puede ver un v\u00eddeo con las explicaciones paso a paso <a href=\"http:\/\/screencast.g2.bx.psu.edu\/galaxy101\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">aqui<\/a>.<\/p>\n<div class=\"entry-content clearfix\">\n<p>Suponga que nos planteamos la siguiente pregunta:<\/p>\n<pre>\u00bfCuales son los 5 exones con un mayor n\u00famero de SNPs en el cromosoma 22?<\/pre>\n<p>Probablemte conozcamos donde encontrar los datos necesarios para responder a esta cuesti\u00f3n: UCSC, Ensembl\u2026 Pero nos falta una herramienta para responder con precisi\u00f3n. Galaxy puede ser la herramienta adecuada.<\/p>\n<\/div>\n<div class=\"entry-content clearfix\"><\/div>\n<\/div>\n<\/div>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Galaxy es una plataforma web de software libre para el an\u00e1lisis de datos en investigaci\u00f3n biom\u00e9dica. Galaxy wiki. Implementaciones de Galaxy Existen muchas implementaciones de Galaxy, usaremos las dos siguientes: Galaxy original,\u00a0Texas Advanced Computing Center Galaxy Europe En esta pr\u00e1ctica veremos los siguientes aspectos de Galaxy: Extracci\u00f3n de datos desde el servidor de la UCSC &hellip; <a href=\"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/galaxy\/\">Continue reading <span class=\"meta-nav\">&rarr;<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"parent":0,"menu_order":12,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/929"}],"collection":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=929"}],"version-history":[{"count":5,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/929\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":1419,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/929\/revisions\/1419"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=929"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}