{"id":96,"date":"2013-05-29T22:38:56","date_gmt":"2013-05-29T20:38:56","guid":{"rendered":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/?page_id=96"},"modified":"2013-10-16T14:39:50","modified_gmt":"2013-10-16T12:39:50","slug":"contenidos","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/otros\/contenidos\/","title":{"rendered":"Contenidos"},"content":{"rendered":"<ol>\n<li>Introducci\u00f3n. Conceptos b\u00e1sicos.<\/li>\n<li>Bases de datos de secuencias. Secuencias de ADN. Codificaci\u00f3n de la informaci\u00f3n en secuencias de DNA. Secuencias de prote\u00ednas. Genomas completos<\/li>\n<li>Navegadores gen\u00f3micos. UCSC Genome Browser. Ensembl Genome Browser.<\/li>\n<li>Rastreo de bases de datos. FASTA y BLAST. BLAT.<\/li>\n<li>An\u00e1lisis de secuencias. El paquete de software EMBOSS. An\u00e1lisis b\u00e1sico.<\/li>\n<li>An\u00e1lisis composicional. Uso de codones. Aleatorizaci\u00f3n de secuencias. Mapas de restricci\u00f3n.<\/li>\n<li>Comparaci\u00f3n de secuencias. Matriz de puntos. Alineamiento global. Alineamiento m\u00faltiple.<\/li>\n<li>Biocomputaci\u00f3n mediante la plataforma Galaxy. Extracci\u00f3n de datos de UCSC. An\u00e1lisis en genoma completo.<\/li>\n<li>Predicci\u00f3n de funci\u00f3n biol\u00f3gica. Predicci\u00f3n de ORFs. Genes procari\u00f3ticos. Genes eucari\u00f3ticos. Predicci\u00f3n de islas CpG: cpgreport. cpgplot. CpGcluster. NGSmethDB.<\/li>\n<li>An\u00e1lisis de datos de secuenciaci\u00f3n masiva (NGS). El formato FASTQ. Preprocesado de reads: FastQC. Mapas: Single- and paired-ends reads.<\/li>\n<li>Detecci\u00f3n de niveles de metilaci\u00f3n. Secuenciaci\u00f3n del ADN tratado con bisulfito. C\u00e1lculo los niveles de metilaci\u00f3n de islas CpG, promotores y cuerpo g\u00e9nico.<\/li>\n<li>An\u00e1lisis funcional. Ontolog\u00edas: Gene Ontology. Babelomics. Diferencias en t\u00e9rminos GO. Diferencias entre dos listas de genes. El interactoma.<\/li>\n<\/ol>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Introducci\u00f3n. Conceptos b\u00e1sicos. Bases de datos de secuencias. Secuencias de ADN. Codificaci\u00f3n de la informaci\u00f3n en secuencias de DNA. Secuencias de prote\u00ednas. Genomas completos Navegadores gen\u00f3micos. UCSC Genome Browser. Ensembl Genome Browser. Rastreo de bases de datos. FASTA y BLAST. BLAT. An\u00e1lisis de secuencias. El paquete de software EMBOSS. An\u00e1lisis b\u00e1sico. An\u00e1lisis composicional. Uso de &hellip; <a href=\"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/otros\/contenidos\/\">Continue reading <span class=\"meta-nav\">&rarr;<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"parent":303,"menu_order":2,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/96"}],"collection":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=96"}],"version-history":[{"count":5,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/96\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":885,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/96\/revisions\/885"}],"up":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/303"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=96"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}