{"id":2301,"date":"2020-02-16T15:18:50","date_gmt":"2020-02-16T13:18:50","guid":{"rendered":"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/genomicafuncional\/?page_id=2301"},"modified":"2025-02-19T10:44:27","modified_gmt":"2025-02-19T08:44:27","slug":"alineamiento-multiple","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/genomicafuncional\/alineamiento-multiple\/","title":{"rendered":"Conservaci\u00f3n de secuencia"},"content":{"rendered":"<h3><strong>Conservaci\u00f3n \/ regi\u00f3n del seed <\/strong><\/h3>\n<!-- \/wp:paragraph --><!-- wp:paragraph -->\n\n<!-- \/wp:paragraph --><!-- wp:quote -->\n<blockquote class=\"wp-block-quote\">\n<ul>\n \t<li>Buscamos la familia miR-139 (Gene family MIPF0000117;\u00a0<a href=\"https:\/\/www.mirbase.org\/results\/?query=mir-139\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">mir-139<\/a>)<\/li>\n \t<li>Marcamos las especies y con &#8216;fetch sequences&#8217; descargamos las secuencias <em>hairpin<\/em><\/li>\n \t<li>Mediante el programa <a href=\"https:\/\/www.ebi.ac.uk\/jdispatcher\/msa\/clustalo\">Omega<\/a> podemos alinear las secuencias y determinar las regiones conservadas.<\/li>\n<\/ul>\n<\/blockquote>\n<!-- \/wp:quote --><!-- wp:paragraph -->\n\n<strong><em>Cuestiones:<\/em><\/strong>\n\n<!-- \/wp:paragraph --><!-- wp:list -->\n<ul>\n \t<li>\u00bfCu\u00e1les son las regiones m\u00e1s conservadas en el alineamiento?<\/li>\n \t<li>\u00bfCu\u00e1ntas sustituciones se observa en el microRNA maduro y en regi\u00f3n del seed?<\/li>\n \t<li>\u00bfCu\u00e1l es el nodo de origen de este microRNA?<\/li>\n<\/ul>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Conservaci\u00f3n \/ regi\u00f3n del seed Buscamos la familia miR-139 (Gene family MIPF0000117;\u00a0mir-139) Marcamos las especies y con &#8216;fetch sequences&#8217; descargamos las secuencias hairpin Mediante el programa Omega podemos alinear las secuencias y determinar las regiones conservadas. Cuestiones: \u00bfCu\u00e1les son las regiones m\u00e1s conservadas en el alineamiento? \u00bfCu\u00e1ntas sustituciones se observa en el microRNA maduro y &hellip; <a href=\"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/genomicafuncional\/alineamiento-multiple\/\">Continue reading <span class=\"meta-nav\">&rarr;<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"parent":0,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/genomicafuncional\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/2301"}],"collection":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/genomicafuncional\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/genomicafuncional\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/genomicafuncional\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/genomicafuncional\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=2301"}],"version-history":[{"count":9,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/genomicafuncional\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/2301\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":2544,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/genomicafuncional\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/2301\/revisions\/2544"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/genomicafuncional\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=2301"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}