{"id":2624,"date":"2026-02-25T17:39:15","date_gmt":"2026-02-25T15:39:15","guid":{"rendered":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/genomicafuncional\/?page_id=2624"},"modified":"2026-02-26T09:56:56","modified_gmt":"2026-02-26T07:56:56","slug":"examen-26","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/genomicafuncional\/examen-26\/","title":{"rendered":"examen 26"},"content":{"rendered":"\n<p>\u00a0<\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Duraci\u00f3n: 1,5 horas<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Medios: Podemos usar todo MENOS al vecino, el m\u00f3vil, programas de chateo u otras formas de comunicar con terceros<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Las respuestas se dan en un fichero (txt, word o PDF) que se mandar\u00e1 a <strong>hackenberg@go.ugr.es<\/strong> al finalizar la prueba poniendo \u2018prueba Gen\u00f3mica Funcional\u2019 en el asunto.\u00a0<\/span><\/p>\n<p><b>Si procede, adjuntar tambi\u00e9n las hojas de c\u00e1lculo o otros ficheros.\u00a0<\/b><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Tanto el nombre del fichero como el fichero como tal deber\u00edan indicar el nombre del estudiante.<\/span><\/p>\n<p data-path-to-node=\"4\"><span style=\"color: #ff0000;\"><b data-path-to-node=\"4\" data-index-in-node=\"0\">IMPORTANTE: Normas de la Prueba<\/b><\/span><\/p>\n<ul data-path-to-node=\"5\">\n<li>\n<p data-path-to-node=\"5,0,0\"><span style=\"color: #ff0000;\"><b data-path-to-node=\"5,0,0\" data-index-in-node=\"0\">Razonamiento obligatorio:<\/b> No se valorar\u00e1 ninguna respuesta que no est\u00e9 brevemente razonada.<\/span><\/p>\n<\/li>\n<li>\n<p data-path-to-node=\"5,1,0\"><span style=\"color: #ff0000;\"><b data-path-to-node=\"5,1,0\" data-index-in-node=\"0\">Uso \u00e9tico de la IA:<\/b> Est\u00e1 estrictamente prohibido introducir los enunciados o secuencias del examen directamente en un modelo de lenguaje. Se permite el uso de IA \u00fanicamente como apoyo para consultas t\u00e9cnicas, sintaxis de herramientas o aclaraci\u00f3n de conceptos.<\/span><\/p>\n<\/li>\n<li>\n<p data-path-to-node=\"5,2,0\"><span style=\"color: #ff0000;\"><b data-path-to-node=\"5,2,0\" data-index-in-node=\"0\">Trazabilidad y Evidencia:<\/b> Toda soluci\u00f3n debe ir acompa\u00f1ada de <b data-path-to-node=\"5,2,0\" data-index-in-node=\"66\">capturas de pantalla incluyendo aspectos como:<\/b><\/span><\/p>\n<ol start=\"1\" data-path-to-node=\"5,2,1\">\n<li>\n<p data-path-to-node=\"5,2,1,0,0\"><span style=\"color: #ff0000;\">La herramienta o base de datos utilizada.<\/span><\/p>\n<\/li>\n<li><span style=\"color: #ff0000;\">El resultado visual obtenido.<\/span><\/li>\n<\/ol>\n<\/li>\n<\/ul>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">\u00a0<\/span><\/p>\n<p><b>1. (7 puntos) Tenemos el nombre de un microRNA: <\/b><b>hsa-mir-27a<\/b><\/p>\n<ul>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"2\"><span style=\"font-weight: 400;\">Indicar los nombres y secuencias de los microRNAs maduros<\/span><\/li>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"2\"><span style=\"font-weight: 400;\">Obtener las secuencia del pre-miRNA<\/span><\/li>\n<\/ul>\n<p><br \/><br \/><\/p>\n<p><b>2. (8 puntos) Tenemos la siguiente secuencia de un posible microRNA, obtenida a partir de una muestra humana.<\/b><\/p>\n<pre><span style=\"font-weight: 400;\">&gt;miRNA_anon<\/span><br \/><span style=\"font-weight: 400;\">UGGAAGUGUCUUAGCUGGUUGUU<\/span><br \/><br \/><\/pre>\n<ul>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"2\"><span style=\"font-weight: 400;\">Sabemos que se trata de un microRNA mutado. \u00bfA qu\u00e9 microRNA en la base de datos miRBase corresponde? Indicar el nombre del microRNA y de la secuencia madura (\u2018el brazo\u2019)<\/span><\/li>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"2\"><span style=\"font-weight: 400;\">Indicar los cambios que existen entre la secuencia can\u00f3nica y la secuencia mutada<\/span><\/li>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"2\"><span style=\"font-weight: 400;\">\u00bfQue impacto sobre las dianas puede(n) tener el\/los cambio(s)? Reportar al menos un gen posiblemente regulado por el microRNA (se puede obtener tanto usando bases de datos o computacionalmente).<\/span><\/li>\n<\/ul>\n<p>\u00a0<\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">3. (3 puntos) <strong>Obtener<\/strong> la secuencia 3\u2019 UTR del transcrito can\u00f3nico del gen TNRC6B. Adjuntar el fichero en el correo al finalizar la prueba.<\/span><\/p>\n<p>\u00a0<\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">4. (5 puntos) \u00bfUna la siguientes 3 secuencias,<\/span><\/p>\n<pre data-path-to-node=\"14,0\"><b data-path-to-node=\"14,0\" data-index-in-node=\"0\">&gt;cand1<\/b> <br \/>CAGUUAUCACAGUGCUGAUGCU\u200bgucuauu\u0421\u200bUaaaggUACAGUACUGUGAUAACUGAA<br \/><b style=\"font-size: revert; color: initial; font-family: -apple-system, BlinkMacSystemFont, 'Segoe UI', Roboto, Oxygen-Sans, Ubuntu, Cantarell, 'Helvetica Neue', sans-serif;\" data-path-to-node=\"14,1\" data-index-in-node=\"0\">&gt;cand2<\/b><br \/>CAGUUAUCACAGUGCUGAUGCU\u200bgucuauu\u0421\u200bUaaaggUACAGUACUGUGAUAACUG<br \/><b style=\"font-size: revert; color: initial; font-family: -apple-system, BlinkMacSystemFont, 'Segoe UI', Roboto, Oxygen-Sans, Ubuntu, Cantarell, 'Helvetica Neue', sans-serif;\" data-path-to-node=\"14,2\" data-index-in-node=\"0\">&gt;cand3<\/b><br \/>CUCAGUUAUCACAGUGCUGAUGCU\u200bgucuauu\u0421\u200bUaaaggUACAGUACUGUGAUAACUGAA<\/pre>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">seg\u00fan su estructura secundaria puede corresponder a un pre-miRNA?<\/span><\/p>\n<p>Indicar tambi\u00e9n la <b data-path-to-node=\"18,0\" data-index-in-node=\"38\">Energ\u00eda Libre de Gibbs <\/b>exacta y la estructura en formato dot-bracket para las 3 secuencias<\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">5. (5 puntos) En siguiente enlace nos lleva a la entrada de un microRNA en la base de datos miRBase <\/span><a href=\"https:\/\/www.mirbase.org\/hairpin\/MI0030983\"><span style=\"font-weight: 400;\">https:\/\/www.mirbase.org\/hairpin\/MI0030983<\/span><\/a><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Discutir si se puede tratar de un microRNA verdadero o de una entrada incorrecta.<\/span><\/p>\n<p><br \/><strong>6. (12 punto) Expresi\u00f3n de microRNAs.<\/strong><br \/><span style=\"font-weight: 400;\">Tenemos la siguiente <\/span><a href=\"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/genomicafuncional\/wp-content\/uploads\/2026\/02\/matrix_RCadj.txt\"><span style=\"font-weight: 400;\">matrix de expresi\u00f3n<\/span><\/a><span style=\"font-weight: 400;\"> con los conteos corregidos por asignaci\u00f3n m\u00faltiple (RCadj). Asi mismo tenemos un fichero con <a href=\"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/genomicafuncional\/wp-content\/uploads\/2026\/02\/datos_secuenciacion.txt\">datos de secuenciacion<\/a> para cada muestra del estudio con las siguientes columnas: 1) nombre de la muestra, 2)<\/span> <span style=\"font-weight: 400;\">n\u00famero total de lecturas (raw reads), 3) lecturas en el an\u00e1lisis, 4) lecturas mapeadas a miRNAs y 5) lecturas con adaptador detectado<\/span><\/p>\n<ol>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"1\"><span style=\"font-weight: 400;\">Normalizar los valores de expresi\u00f3n (RCadj) usando el n\u00famero total de lecturas en el an\u00e1lisis.\u00a0<\/span><\/li>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"1\"><span style=\"font-weight: 400;\">Normalizar los valores de expresi\u00f3n usando el total de lecturas mapeadas a microRNAs.<\/span><\/li>\n<li aria-level=\"1\">Calcular el porcentaje de lecturas que corresponden a microRNAs para cada muestra<\/li>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"1\"><span style=\"font-weight: 400;\">Calcular la magnitud de cambio (FC) entre las muestras SG_* y las muestras MG_*<\/span><\/li>\n<\/ol>\n<p><br \/><br \/><br \/><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>\u00a0 Duraci\u00f3n: 1,5 horas Medios: Podemos usar todo MENOS al vecino, el m\u00f3vil, programas de chateo u otras formas de comunicar con terceros Las respuestas se dan en un fichero (txt, word o PDF) que se mandar\u00e1 a hackenberg@go.ugr.es al finalizar la prueba poniendo \u2018prueba Gen\u00f3mica Funcional\u2019 en el asunto.\u00a0 Si procede, adjuntar tambi\u00e9n las &hellip; <a href=\"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/genomicafuncional\/examen-26\/\">Continue reading <span class=\"meta-nav\">&rarr;<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"parent":0,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/genomicafuncional\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/2624"}],"collection":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/genomicafuncional\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/genomicafuncional\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/genomicafuncional\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/genomicafuncional\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=2624"}],"version-history":[{"count":11,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/genomicafuncional\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/2624\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":2637,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/genomicafuncional\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/2624\/revisions\/2637"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/genomicafuncional\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=2624"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}