{"id":1043,"date":"2014-10-10T12:52:47","date_gmt":"2014-10-10T10:52:47","guid":{"rendered":"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/secuencias\/?page_id=1043"},"modified":"2024-09-16T17:48:29","modified_gmt":"2024-09-16T15:48:29","slug":"alineamientos","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/secuencias\/alineamientos\/","title":{"rendered":"Alineamiento global de secuencias"},"content":{"rendered":"<div class=\"entry-content clearfix\">\n<p>La t\u00e9cnica b\u00e1sica para hacer un alineamiento de secuencias (tanto de ADN como de prote\u00ednas) es la <b>matriz de puntos<\/b>. Ello permite hacer un <b>alineamiento global<\/b> (a todo lo largo de las secuencias que se comparan).<\/p>\n<h2>Matriz de puntos<\/h2>\n<div class=\"entry-content clearfix\">\n<p><a href=\"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-content\/uploads\/2013\/06\/DotMatrix.jpg\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\"><img loading=\"lazy\" class=\"alignnone wp-image-374\" src=\"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/bioinfo\/wp-content\/uploads\/2013\/06\/DotMatrix-300x206.jpg\" alt=\"DotMatrix\" width=\"348\" height=\"239\" srcset=\"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/secuencias\/wp-content\/uploads\/2013\/06\/DotMatrix-300x206.jpg 300w, https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/secuencias\/wp-content\/uploads\/2013\/06\/DotMatrix.jpg 662w\" sizes=\"(max-width: 348px) 100vw, 348px\" \/><\/a><\/p>\n<ul>\n<li><a href=\"https:\/\/www.ebi.ac.uk\/Tools\/seqstats\/emboss_dottup\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">EMBOSS \u2013 dottup<\/a><\/li>\n<\/ul>\n<h2>Alineamiento global<\/h2>\n<p>Mediante un alineamiento global las secuencias se alinean en su totalidad, de principio a fin. El algoritmo b\u00e1sico para ello es el de Needleman-Wunsch.<\/p>\n<div class=\"entry-content clearfix\">\n<ul>\n<li><a href=\"http:\/\/emboss.bioinformatics.nl\/cgi-bin\/emboss\/needle\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">EMBOSS \u2013 needle<\/a><\/li>\n<\/ul>\n<\/div>\n<hr>\n<div class=\"entry-content clearfix\">\n<h2><strong>Ejercicios<\/strong><\/h2>\n<\/div>\n<ul>\n<li><a href=\"https:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/nuccore\/NG_007992.1?report=genbank\">Gen Humano B-Actina<\/a><\/li>\n<li><a href=\"https:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/nuccore\/NM_001101.5?report=genbank\">mRNA Humano B-Actina<\/a><\/li>\n<li><a href=\"https:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/nuccore\/NM_213719.1?report=genbank\">mRNA Xenopus Tropicalis B-Actina<\/a><\/li>\n<\/ul>\n<ol>\n<li>Compara mediante una matriz de puntos el mRNA y la secuencia completa del gen humano de la B-Actina. \u00bfQu\u00e9 observamos en la matriz de puntos? \u00bfC\u00f3mo se explica?<\/li>\n<li>Compara el mRNA humano de la B-Actina con el mRNA de Xenopus. \u00bfPodemos decir que la secuencia mensaje de la B-actina se encuentra conservada entre estas especies?<\/li>\n<\/ol>\n<\/div>\n<hr>\n<div class=\"entry-content clearfix\">\n<p>&nbsp;<\/p>\n<\/div>\n<\/div>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>La t\u00e9cnica b\u00e1sica para hacer un alineamiento de secuencias (tanto de ADN como de prote\u00ednas) es la matriz de puntos. Ello permite hacer un alineamiento global (a todo lo largo de las secuencias que se comparan). Matriz de puntos EMBOSS \u2013 dottup [&hellip;]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"parent":0,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/secuencias\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1043"}],"collection":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/secuencias\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/secuencias\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/secuencias\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/secuencias\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=1043"}],"version-history":[{"count":13,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/secuencias\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1043\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":2190,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/secuencias\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1043\/revisions\/2190"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/secuencias\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=1043"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}