{"id":1329,"date":"2015-12-07T22:56:28","date_gmt":"2015-12-07T20:56:28","guid":{"rendered":"http:\/\/bioinfo2.ugr.es\/secuencias\/?page_id=1329"},"modified":"2024-09-17T09:11:30","modified_gmt":"2024-09-17T07:11:30","slug":"introduccion-a-galaxy","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/secuencias\/introduccion-a-galaxy\/","title":{"rendered":"An\u00e1lisis en genoma completo mediante Galaxy"},"content":{"rendered":"<p><b>Galaxy<\/b> es una plataforma web de software libre para el an\u00e1lisis de datos en investigaci\u00f3n biom\u00e9dica.<\/p>\n<ul>\n<li><a href=\"http:\/\/wiki.galaxyproject.org\/Learn\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Galaxy wiki<\/a><\/li>\n<li><a href=\"https:\/\/galaxyproject.github.io\/training-material\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Galaxy training<\/a><\/li>\n<\/ul>\n<h2>Implementaciones de Galaxy<\/h2>\n<p>Existen muchas <a href=\"http:\/\/wiki.galaxyproject.org\/PublicGalaxyServers\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">implementaciones de Galaxy<\/a>, usaremos las dos siguientes:<\/p>\n<ul>\n<li><a href=\"https:\/\/usegalaxy.org\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Galaxy original,&nbsp;<\/a>Texas Advanced Computing Center<\/li>\n<li><a href=\"https:\/\/usegalaxy.eu\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Galaxy Europe<\/a><\/li>\n<\/ul>\n<ul>\n<li><a href=\"http:\/\/galaxy.nbic.nl\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Andromeda, <\/a>Netherlands Bioinformatics Centre<\/li>\n<\/ul>\n<p>Aqui veremos los siguientes aspectos de Galaxy:<\/p>\n<ul>\n<li>Extracci\u00f3n de datos desde el servidor de la UCSC<\/li>\n<li>Manipulaci\u00f3n b\u00e1sica de datos<\/li>\n<li>Las \u2018Historias\u2019 en Galaxy<\/li>\n<\/ul>\n<p>Puede ver un v\u00eddeo con las explicaciones paso a paso <a href=\"http:\/\/screencast.g2.bx.psu.edu\/galaxy101\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">aqui<\/a>.<\/p>\n<div class=\"entry-content clearfix\">\n<p>Suponga que nos planteamos la siguiente pregunta:<\/p>\n<pre>\u00bfCuales son los 5 exones con un mayor n\u00famero de SNPs en el cromosoma 22?<\/pre>\n<p>Probablemte conozcamos donde encontrar los datos necesarios para responder a esta cuesti\u00f3n: UCSC, Ensembl\u2026 Pero nos falta una herramienta para responder con precisi\u00f3n. Galaxy puede ser la herramienta adecuada.<\/p>\n<\/div>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Galaxy es una plataforma web de software libre para el an\u00e1lisis de datos en investigaci\u00f3n biom\u00e9dica. Galaxy wiki Galaxy training Implementaciones de Galaxy Existen muchas implementaciones de Galaxy, usaremos las dos siguientes: Galaxy original,&nbsp;Texas Advanced Computing Center Galaxy Europe Andromeda, Netherlands Bioinformatics [&hellip;]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"parent":0,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/secuencias\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1329"}],"collection":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/secuencias\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/secuencias\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/secuencias\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/secuencias\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=1329"}],"version-history":[{"count":5,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/secuencias\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1329\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":2200,"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/secuencias\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1329\/revisions\/2200"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/bioinfo2.ugr.es\/secuencias\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=1329"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}