Análisis de secuencias

Máster en Genética y Evolución, Universidad de Granada

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Introducción
Bases de datos
Análisis básico de secuencias
Navegadores genómicos
Análisis en genoma completo mediante Galaxy
- Exones con más SNPs (1)
- Exones con más SNPs (2)
Workflows 1: Programación
Workflows 2: Ejecución
Alineamiento global de secuencias
Alineamiento local: Rastreo de bases de datos
Alineamiento múltiple: Filogenia molecular
Jupyter Notebook
Detección de variantes mediante NGS. 1: Preprocesado y alineamiento
Detección de variantes mediante NGS. 2: Filtrado y visualización
Detección de variantes mediante NGS. 3: Efectos biológicos
Predicción computacional de islas CpG
Metilación del ADN

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Manuales en línea:

A science primer:
Genomics and its impact on Medicine and Society. A 2001 primer
Dictionary of Genetic Terms
Bioinformatics Educational Resource
Tutorial de Perl
Primer on Molecular Genetics

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Sequence analysis course (Dr. José R, Valverde, EMBNet/CNB)
Computational Phylogenetics (CSC BioBox)
BioComputing hypertext coursebook
BioComputing course on the Internet
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Biocomputing Course Resource List
Curso de HTML (Asociación de Internautas)

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Horario: L, X y V: 12-14h

Calendario: 21 de octubre al 27 de noviembre, 2019

Aula: OS1 (Sótano de matemáticas)

Comienzo de las clases: lunes 21 de octubre, 12h.

Para un mayor aprovechamiento de la asignatura, se recomienda acudir a clase con ordenador portatil o tableta.

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