1. Análisis de la secuencia de un pseudogen humano
Objetivo: Investigar la causa de la pérdida del potencial codificante de los siguientes pseudogenes humanos de la B-actina: pseudogen 1 y pseudogen 2.
Método: Utilice las herramientas para el estudio de composición y alineamiento de secuencias vistos en clase.
Redacte un fichero en formato pdf con extensión de una cara (A4) identificando las posibles modificaciones que conllevaron la pérdida de potencial codificante de dichos pseudogenes, argumentar los hallazgos con bibliografía relacionada se valorará positivamente. Para su valoración suba el documento a la tarea “Análisis de la secuencia de un pseudogen humano” en la plataforma prado.
Fecha límite de entrega: 30 de Octubre 2023
2. Análisis en genoma completo mediante Galaxy
Objetivo: Determinar los contenedores con mayor contenido de algún elemento genómico.
Método: Elabore un historia en Galaxy que permita alcanzar dicho objetivo.
Debe utilizar un contenedor y un contenido DIFERENTES a los que usamos en clase. Ejemplos:
Contenedores: genes, bandas cromosómicas, etc.
Contenido: Diferentes familias de SINEs, LINEs, islas CpG, etc
De la misma manera, elija una especie o un cromosoma DIFERENTES a los que usamos en clase (cromosoma 22 de humanos).
Extraiga un workflow que permita automatizar este proceso.
Comparta tanto la historia como el workflow mediante sendos enlaces y súbalos en un fichero pdf a la tarea “Análisis en genoma completo mediante Galaxy” en la plataforma prado.
Fecha límite de entrega: 13 de Noviembre 2023