Análisis de una secuencia anónima (sequence) mediante BLAST
Preguntas:
- ¿De gen se trata y a que especie pertenece?
- ¿Este gen tiene homólogos en otras especies?
- ¿Este gen tiene variación transcripcional y diferentes isoformas a nivel de proteína?
Buscar información del gen en NCBI gene
Preguntas:
- ¿Qué es la función de este gen?
- ¿Cuantas isoformas tiene?
Generar un alineamiento local usando el algoritmo de Smith-Waterman
Secuencias: NP_009231.2 y NP_009225.1
Preguntas
- ¿A que corresponde el hueco en el alineamiento?
Búsqueda de una secuencia (sec29) en el genoma: BLAT
Preguntas:
- ¿A que cromosoma y coordenadas corresponde esta secuencia?
- ¿Qué gen contiene la secuencia?
- ¿Qué función tiene este gen, y/o a que enfermedad(es) está asociado?