Prácticas

Práctica 1 (09/10; O21/O21). Calcular las propiedades básicas de una secuencia mediante un programa en Perl

Práctica 2 (06/11; O21/O22). Analizar datos de secuenciación masiva I (re-secuenciación): Calidad de la secuenciación, preprocesamiento, mapeo de las lecturas cortas frente al genoma, detección de variantes, determinar el posible efecto de la variación.

Práctica 3 (13/11; O21/O22). Analizar datos de secuenciación masiva II (RNA pequeño): calidad, detección del adaptador, cuantificar los niveles de expresión mediante el mapeo de lecturas, determinación de la expresión diferencial (magnitud del cambio y significación estadística).

Práctica 4 (27/11; O21/O22): Visualizar datos de expresión génica mediante R. Clusterización y heatmaps.