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Conservación de secuencia

Conservación / región del seed

  • Buscamos la familia miR-139 (Gene family MIPF0000117; mir-139)
  • Marcamos las especies y con ‘fetch sequences’ descargamos las secuencias hairpin
  • Mediante el programa Omega podemos alinear las secuencias y determinar las regiones conservadas.
Cuestiones:
  • ¿Cuáles son las regiones más conservadas en el alineamiento?
  • ¿Cuántas sustituciones se observa en el pre-microRNA, microRNA maduro, región del seed?
  • ¿Cuál es la especie evolutivamente más alejado de los humanos en la que se encuentra el microRNA asignado al alumno?

Clases (Parte I: Computacional)

Horario
10-12/13 h en la O3
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Examen:

4 de marzo (9-13 horas, aula O3)