Conservación / región del seed

Descargamos el fichero de familias (en la sección de descargas) o directamente de este enlace (miFam.txt). Buscamos la familia miR-139 una y descargamos (mediante la opción de ‘search’ & ‘Get sequence’) las secuencias de 5 miembros de la familia (en 5 especies diferentes) poniendo las secuencias en un fichero multifasta. Mediante el programa Omega podemos alinear las secuencias y determinar las regiones conservadas.

• ¿Cuáles son las regiones más conservadas en el alineamiento?
• ¿Cuántas sustituciones se observa en el pre-microRNA, microRNA maduro, región del seed?
• ¿Cuál es la especie evolutivamente más alejado de los humanos en la que se encuentra el microRNA asignado al alumno?