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miRNA: estructura secundaria

Estructura secundaria

Usaremos el programa RNAfold para calcular la estructura secundaria del pre-microRNA. Mediante shuffleseq podemos aleatorizar la secuencia del pre-microRNA comparando las propiedades principales entre pre-microRNA y la secuencia aleatoria.

Cuestiones:

  • Longitud del pre-microRNA
  • Longitud del bucle (loop)
  • La energía de enlace
  • El número de enlaces del pre-microRNA
  • El número de enlaces dentro del dúplex que forman mature/mature*

Clases (Parte I: Computacional)

Horario
10-12h
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Aulas
OS1: 17, 19, 20, 26, 27 de febrero; 4 de marzo

O21: 18, 21 de febrero; 2 de marzo

O3: 3 de marzo

Laboratorio de Genética Molecular: 24, 25 de febrero

Examen:

5 de marzo en el aula O21/22