A lo largo de estas asignatura vamos a analizar las propiedades principales de los microRNAs. Cada alumno ha obtenido un microRNA con el que trabajará.
Objetivos:
- Entender la función y la biogénesis de los microRNAs
- Manejar la base de datos miRBase
- Entender la nomenclatura de los microRNAs
- Saber detectar variación de secuencia en un microRNA
- Detectar posibles dianas de un microRNAs
- Calcular la estructura secundaria de una molécula de ARN
- Saber interpretar el alineamiento múltiple entre secuencias pre-microRNAs de diferentes especies: i) cual es el brazo funcional? ii) donde se ubica la región semilla?, iii) donde se encuentra el bucle?
- Generar los perfiles de expresión a partir de datos de secuenciación masiva
- Determinar los microRNAs que se expresan diferencialmente
- Predecir las posibles funciones de los microRNAs que se expresan diferencialmente
Programas que necesitaremos
- El editor de texto: Notepad++
- Usaremos el miRNA hsa-mir-125a para practicar