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miRNAs: Generalidades

A lo largo de estas asignatura vamos a analizar las propiedades principales de los microRNAs. Cada alumno ha obtenido un microRNA con el que trabajará.

Objetivos:

  • Entender la función y la biogénesis de los microRNAs
  • Manejar la base de datos miRBase
  • Entender la nomenclatura de los microRNAs
  • Saber detectar variación de secuencia en un microRNA
  • Detectar posibles dianas de un microRNAs
  • Calcular la estructura secundaria de una molécula de ARN
  • Saber interpretar el alineamiento múltiple entre secuencias pre-microRNAs de diferentes especies: i) cual es el brazo funcional? ii) donde se ubica la región semilla?, iii) donde se encuentra el bucle?
  • Generar los perfiles de expresión a partir de datos de secuenciación masiva
  • Determinar los microRNAs que se expresan diferencialmente
  • Predecir las posibles funciones de los microRNAs que se expresan diferencialmente

Programas que necesitaremos

  • El editor de texto: Notepad++
  • Usaremos el miRNA hsa-mir-125a para practicar

Enlaces importantes

Clases (Parte I: Computacional)

Horario
10-12h
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Aulas
OS1: 17, 19, 20, 26, 27 de febrero; 4 de marzo

O21: 18, 21 de febrero; 2 de marzo

O3: 3 de marzo

Laboratorio de Genética Molecular: 24, 25 de febrero

Examen:

5 de marzo en el aula O21/22