Generalidades:

Duración: 1,5 horas

Medios: Podemos usar todo MENOS al vecino, el móvil, programas de chateo u otras formas de comunicar con terceros

Las respuestas se dan en un fichero (txt, word o PDF) que se mandará a al finalizar la prueba poniendo ‘prueba Genómica Funcional’ en el asunto.

Tanto el nombre del fichero como el fichero como tal deberían indicar el nombre del alumno.

IMPORTANTE: ¡Razonar brevemente todas las respuestas!

1) Analizaremos el microRNA mir-210 en la especie Mus musculus

Reportar:

• Los nombres y las secuencias de los microRNAs maduros (3 puntos)
• El brazo funcional (Razonar brevemente) (3 puntos)

2) Generalmente se considera que dos microRNAs pertenecen a la misma familia si tienen la misma secuencia semilla

• Determinar el nombre del microRNA que corresponde a esta secuencia: UGUGCCGUGUGACAGCGGCUGA (3 puntos)
• ¿Porque se puede decir que esta secuencia ha recibido un nombre erróneo?  (3 puntos)

3) Se ha obtenido las secuencias precursoras de un microRNA (miRNAs) en 5 especies diferentes. Determinar a partir de un alineamiento múltiple:

• Cual de los dos brazos es mas probablemente el funcional (4 puntos)

• Marcar la posición de la secuencia madura funcional dentro de alineamiento múltiple (5 puntos)

4) tenemos la siguiente secuencia precursora (no necesariamente pre-microRNA) de un micoRNA nuevo y el correspondiente brazo funcional: hsa-miR-X2-5p

• Determinar la secuencia del pasajero hsa-miR-X2-3p (5 puntos)

Razonar la respuesta.

5) Tenemos un gen con 3 isoformas. El siguiente fichero contiene las 3’UTR de estas isoformas que se expresan preferentemente en el hígado, cerebro y musculo. Tenemos también el siguiente microRNA que se expresa preferentemente en el cerebro.

• Determinar las 3’UTR para las que este microRNA tiene dianas (4 puntos)

• ¿Que función podría tener este microRNA? (4 puntos)

Razonar brevemente.

6) Tenemos la siguiente matrix de expresión que contiene datos de células y exosomas.

• ¿Que 5 microRNAs tienen la expresión media mas alta en las células? (3 puntos). Dar los nombres de los microRNAs y la media de los valores de expresión.

• ¿Que microRNAs están al menos dos veces mas frecuentes en exosomas comparado con las células? (3 puntos)