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Análisis de secuencias

Máster en Genética y Evolución, Universidad de Granada

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Cursos

Cursos

Computational Genomics with R , Altuna Akalin, 2020-09-30.
Introduction to Data Science, Rafael A. Irizarry, HarvardX Data Science Series, 2018-08-31

Temario

Introducción
Bases de datos
Introducción a Galaxy
Análisis básico de secuencias
Alineamiento global de secuencias
Alineamiento local: Rastreo de bases de datos
Alineamiento múltiple
Filogenia molecular
Navegadores genómicos
Análisis en genoma completo mediante Galaxy
- Exones con más SNPs (1)
- Exones con más SNPs (2)
Workflows 1: Programación
Workflows 2: Ejecución
Predicción computacional de genes
Predicción computacional de islas CpG
Detección de variantes mediante NGS. 1: Preprocesado y alineamiento
Detección de variantes mediante NGS. 2: Filtrado y visualización
Detección de variantes mediante NGS. 3: Efectos biológicos
Análisis de metilación del ADN mediante NGS. 1: Preprocesado y alineamiento
Análisis de metilación mediante NGS. 2: Cuantificación de la metilación y análisis globales
Análisis de metilación mediante NGS. 3: Análisis diferenciales e interpretación biológica

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