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Análisis de secuencias

Máster en Genética y Evolución, Universidad de Granada

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Tutorías

  Tutoría presencial: Viernes, 10-11 h
Facultad de Ciencias, Dpto. de Genética, Despacho 17
  Dr. Guillermo Barturen
Dr. Michael Hackenberg
En el asunto del mensaje se debe poner la palabra ‘secuencias’

 

Temario

  • Introducción
  • Bases de datos
  • Introducción a Galaxy
  • Análisis básico de secuencias
  • Alineamiento global de secuencias
  • Alineamiento local: Rastreo de bases de datos
  • Alineamiento múltiple
  • Filogenia molecular
  • Navegadores genómicos
  • Análisis en genoma completo mediante Galaxy
    • Exones con más SNPs (1)
    • Exones con más SNPs (2)
  • Workflows 1: Programación
  • Workflows 2: Ejecución
  • Predicción computacional de genes
  • Predicción computacional de islas CpG
  • Detección de variantes mediante NGS. 1: Preprocesado y alineamiento
  • Detección de variantes mediante NGS. 2: Filtrado y visualización
  • Detección de variantes mediante NGS. 3: Efectos biológicos
  • Análisis de metilación del ADN mediante NGS. 1: Preprocesado y alineamiento
  • Análisis de metilación mediante NGS. 2: Cuantificación de la metilación y análisis globales
  • Análisis de metilación mediante NGS. 3: Análisis diferenciales e interpretación biológica

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