1. Análisis de la secuencia de un pseudogen humano

Objetivo: Investigar la causa de la pérdida del potencial codificante de los siguientes pseudogenes humanos de la B-actina: pseudogen 1 y pseudogen 2.
Método: Utilice las herramientas para el estudio de composición y alineamiento de secuencias vistos en clase.

Redacte un fichero en formato pdf con extensión de una cara (A4) identificando las posibles modificaciones que conllevaron la pérdida de potencial codificante de dichos pseudogenes, argumentar los hallazgos con bibliografía relacionada se valorará positivamente. Para su valoración suba el documento a la tarea “Análisis de la secuencia de un pseudogen humano” en la plataforma prado.

Fecha límite de entrega: 27 de Octubre de 2024

2. Análisis en genoma completo mediante Galaxy

Objetivo: Determinar los contenedores con mayor contenido de algún elemento genómico.
Método: Elabore un historia en Galaxy que permita alcanzar dicho objetivo.

Debe utilizar un contenedor y un contenido DIFERENTES a los que usamos en clase. Ejemplos:

Contenedores: genes, bandas cromosómicas, etc.
Contenido: Diferentes familias de SINEs, LINEs, islas CpG, etc

De la misma manera, elija una especie o un cromosoma DIFERENTES a los que usamos en clase (cromosoma 22 de humanos).
Extraiga un workflow que permita automatizar este proceso.
Entregue un fichero pdf con los resultados obtenidos y los pantallazos necesarios del workflow a la tarea “Análisis en genoma completo mediante Galaxy” en la plataforma prado.

Fecha límite de entrega: 06 de Noviembre de 2024