Generalidades:

Duración: 2 horas

Medios: Todo MENOS el contacto con terceros mediante móvil, programas de chateo u otras formas de comunicación

Las respuestas se darán en un fichero de texto (por ejemplo Word o PDF) que se mandará a se.rg1702206249u.og@1702206249grebn1702206249ekcah1702206249 al finalizar la prueba poniendo ‘prueba bioinformática’ en el asunto. Nombrar el fichero de texto usando nombre/apellidos.

 

1) (10 puntos) Tenemos las coordenadas genómicas del ensamblado mm9 del ratón (Mus musculus) chr12: 57,770,212 – 57,902,714

• Calcular el G+C de la secuencia
• Calcular las frecuencias de dinucleótidos
• ¿Que dinucleótidos ocurren más frecuente y cuales menos frecuente de los esperado por azar? Razonar las frecuencias de al menos 3 dinucleótidos diferentes

 

2) (10 puntos) Tenemos la siguiente secuencia de ADN de origen bacteriano.

• ¿Cuántas CDS completas contiene esta secuencia?
• Anotar los nombres de los genes y la longitud de sus CDSs

 

3) (10 puntos) Se ha obtenido la secuencia de un mRNA de dos individuos: secuencia1 y secuencia2

• Dar el nombre del transcrito (RefSeq) y nombre del gen
• ¿Cuál de los dos individuos tiene mayor probabilidad de sufrir una enfermedad grave en el futuro? Razonar brevemente

 

4) (14 puntos) Tenemos la siguiente secuencia cromosómica: secuencia.

• Determinar las coordenadas de la secuencia en el genoma humano
• ¿Cuántos genes hay en ésta región?
• ¿Cuántos transcritos hay en RefSeq gene anotados para este gen?
• Llevar a cabo una predicción de genes y comparar con la anotación

 

5) (6 puntos) Tenemos el transcrito NM_000546.6

• ¿A qué gen y a que especie pertenece?
• ¿Qué es la longitud y el contenido en G+C de su región codificante?