1. Predicción de genes en procariotas (20 puntos)
Objetivo: Determinar la bondad de la predicción de genes en una especie procariota
Cada estudiante ha de elegir una especie procariota realizando las siguientes tareas:
- Hacer una predicción de genes
- Determinar la calidad de la predicción
- Escribir un breve report que debe incluir:
- información básica sobre la especie elegida
- tamaño del genoma, %G+C, número de genes en la anotación, longitud media de las regiones codificantes
- calidad de la predicción (Sensibilidad y Especificidad)
Preparando el report usando solamente una hebra (como demostrado en clase) dará un máximo de 19 puntos. Un punto adicional se puede obtener calculando la bondad en las dos hebras.
El report y las hojas de calculo (o la ‘historia’ de Galaxy) se envían a *protected email*
Fecha límite de entrega: sábado 20 de febrero.